Может быть они не соответствуют принятому у себя представлению о красоте, отсюда и все персонажи из аниме с невероятно большими глазами. Может быть, это как то связано
На самом деле, в аниме и манге именно глаза выражают весь спектр эмоций. Там очень много разных тонкостей.
Например, чем больше глаза тем обычнее наивнее персонаж ( или моложе).
У отрицательных персонажей глаза часто сужены, иногда закрыты или спрятаны под челкой. Нередко их рисуют похожими на глаза змеи или хищной птицы.
У хитрецов и подчеркнуто вежливых персонажей глаза лисьи — всё время закрытые, будто в улыбке.
У нейтральных персонажей могут быть достаточно большие глаза, но с мелкими зрачками. А если у героя заберут душу или лишат его воли магическим путем, глаза и вовсе потускнеют, потеряют блики и станут безжизненными.
Ну и, разумеется, большие глаза - извечный комплекс.